85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3474 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  88.96 
 
 		 299 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  88.63 
 
 		 299 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  88.29 
 
 		 299 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  82.96 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  82.96 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  82.96 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  82.59 
 
 		 307 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  80.37 
 
 		 307 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  50.71 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  52.04 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  51.69 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  51.69 
 
 		 295 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  56.7 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  51.31 
 
 		 295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  50.92 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  50.74 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  48.76 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  54.02 
 
 		 293 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  50.37 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 404 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  50.73 
 
 		 444 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 486 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.17 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  54.02 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  47.78 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  47.92 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  45.86 
 
 		 303 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  49.06 
 
 		 292 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  41.77 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  48.51 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  46.44 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.84 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.72 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.29 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  34.83 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.45 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.06 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.91 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 526 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.11 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  21.76 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  23.63 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  22.94 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  22.28 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.9 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  23.56 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  23.56 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  22.08 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  22.45 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.42 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  21.22 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.24 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  22.41 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  20.17 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  20.17 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>