90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0822 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  100 
 
 		 269 aa  547  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  49.13 
 
 		 261 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  44.65 
 
 		 238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  39.2 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  42.45 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  40.76 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  34.62 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  37.12 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  33.94 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  36.04 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  33.03 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  36.95 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  36.45 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  35.96 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  35.96 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  36.45 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  32.56 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  32.16 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  33.04 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  35.96 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  31.46 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  35.05 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  33.02 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  40.74 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  38.52 
 
 		 158 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.53 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.89 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  38.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  36.9 
 
 		 319 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.43 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  38.75 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.27 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  34.21 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  40.91 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  40.91 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.78 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 317 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  24.49 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  24.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  21.4 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.85 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  20.79 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  25.97 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.14 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  24.88 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 292 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 317 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>