45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6144 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  37.12 
 
 
269 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  42.6 
 
 
258 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  39.27 
 
 
246 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  36.7 
 
 
237 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  33.91 
 
 
257 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  34.7 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  35.16 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  34.25 
 
 
256 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  34.25 
 
 
256 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  36.53 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  34.88 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  33.74 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  41.55 
 
 
260 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  33.8 
 
 
257 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  32.76 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  31.6 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  36.7 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  31.39 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  38.39 
 
 
260 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  29.64 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  30.32 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  35.1 
 
 
171 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  26.98 
 
 
248 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  35.06 
 
 
158 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.63 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.51 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  25.81 
 
 
341 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
318 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.12 
 
 
335 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  44.93 
 
 
219 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.22 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.12 
 
 
335 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.77 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  25.37 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
617 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>