268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0103 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  100 
 
 
341 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  55.22 
 
 
344 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  49.71 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  48.67 
 
 
342 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  51.6 
 
 
357 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  49.85 
 
 
359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  49.13 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  49.42 
 
 
366 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  50.87 
 
 
362 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  49.56 
 
 
359 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.73 
 
 
357 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  49.27 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  50.28 
 
 
384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  49.86 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  49.71 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  49.71 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  49.71 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  49.71 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  50.28 
 
 
358 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 
359 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  49.71 
 
 
359 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  50.87 
 
 
363 aa  298  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  49.71 
 
 
359 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  49.71 
 
 
359 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  47.08 
 
 
359 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  49.43 
 
 
359 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  46.7 
 
 
357 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  46.99 
 
 
358 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  43.43 
 
 
394 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  49.29 
 
 
356 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  50.31 
 
 
331 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  50.15 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  41.85 
 
 
343 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  43.27 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  41.62 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  43.24 
 
 
354 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  40.52 
 
 
352 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  39.65 
 
 
354 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  41.14 
 
 
400 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  41.67 
 
 
357 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  40.23 
 
 
348 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
352 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 
363 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 
349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
371 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  39.71 
 
 
365 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 
365 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  41.74 
 
 
374 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  42.77 
 
 
335 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  38.68 
 
 
354 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  37.43 
 
 
349 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
344 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  40.71 
 
 
349 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  37.35 
 
 
344 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 
369 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  35.06 
 
 
329 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 
340 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  35.38 
 
 
353 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
321 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  33.44 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
329 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 
324 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
324 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  33.86 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
324 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
324 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
325 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
332 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
350 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
332 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
346 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.47 
 
 
328 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.83 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
334 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
334 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.13 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
323 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  27.58 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.6 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>