115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1168 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 390 aa  806    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.78 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.03 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  23.86 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  21.85 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.77 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.41 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.41 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  22.41 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.18 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  22.89 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  23.81 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  23.42 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  21.65 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  20.87 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  21.95 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  26.18 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  21.54 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.64 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.02 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 332 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 315 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  21.98 
 
 		 321 aa  53.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  21.15 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  22.27 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 249 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  21.03 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  41.54 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.12 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  20.08 
 
 		 862 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  20.95 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  21.55 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  19.83 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  29.6 
 
 		 653 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  22.44 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  22.08 
 
 		 316 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  22.29 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 333 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  22.84 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 654 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  22.05 
 
 		 257 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 322 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  20.63 
 
 		 316 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  18.88 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  23.04 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  20.8 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  21.72 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>