106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1715 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  74.52 
 
 		 653 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  54.55 
 
 		 653 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  57.05 
 
 		 1290 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  50.08 
 
 		 663 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  60.58 
 
 		 657 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  49.92 
 
 		 660 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  53.67 
 
 		 662 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  54.34 
 
 		 625 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  49.62 
 
 		 651 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  49.62 
 
 		 651 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  51.78 
 
 		 675 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  50.54 
 
 		 653 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  54.34 
 
 		 625 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  52.54 
 
 		 641 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  54.34 
 
 		 625 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  51.1 
 
 		 654 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  53.4 
 
 		 625 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1340    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  73.89 
 
 		 653 aa  992    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  54.87 
 
 		 626 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  49.45 
 
 		 667 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  48.94 
 
 		 658 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  48.26 
 
 		 659 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 		 677 aa  646    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  50.77 
 
 		 658 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  72.26 
 
 		 652 aa  978    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  49.53 
 
 		 648 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  51.75 
 
 		 661 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  49.61 
 
 		 655 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  52.28 
 
 		 656 aa  710    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  53.14 
 
 		 655 aa  730    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  54.72 
 
 		 657 aa  724    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  50.84 
 
 		 657 aa  691    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  49.61 
 
 		 648 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  52.37 
 
 		 611 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.89 
 
 		 661 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  47.04 
 
 		 661 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  46.89 
 
 		 661 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.21 
 
 		 617 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  46.43 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  52.68 
 
 		 629 aa  620  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.59 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  46.43 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  46.43 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  50.33 
 
 		 621 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  51.34 
 
 		 631 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  50.47 
 
 		 658 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  49.3 
 
 		 636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  47.88 
 
 		 696 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  45.83 
 
 		 661 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  50.49 
 
 		 628 aa  599  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  49.37 
 
 		 658 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  45.51 
 
 		 660 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  47.33 
 
 		 673 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 670 aa  568  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  44.99 
 
 		 701 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  46.56 
 
 		 607 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  48.89 
 
 		 645 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  44.99 
 
 		 653 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  43.14 
 
 		 654 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  42.9 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 609 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  45.15 
 
 		 704 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 		 659 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  44.76 
 
 		 700 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  43.61 
 
 		 680 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  44.05 
 
 		 655 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 		 687 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  44.2 
 
 		 704 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  44.62 
 
 		 669 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  41.44 
 
 		 668 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 673 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.81 
 
 		 663 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 662 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 657 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  40.99 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.81 
 
 		 666 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  39.75 
 
 		 661 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 663 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 595 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  30.4 
 
 		 635 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  42.76 
 
 		 357 aa  257  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 591 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  50.24 
 
 		 225 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 441 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 		 444 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  27.2 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 408 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  25.4 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  23.58 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 		 414 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>