56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0410 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 488 aa  989    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 298 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1624  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  0.0292664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.62 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.98 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.49 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 320 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 334 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.14 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.44 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 479 aa  50.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 304 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  30.94 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  24.86 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 246 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 249 aa  47  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  24.4 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  23.08 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 656 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 221 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 273 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  25.44 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 319 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 312 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 319 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 273 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 		 295 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  34.43 
 
 		 289 aa  43.5  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 298 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>