55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1624 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1624  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 494 aa  1019    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  0.0292664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  27.63 
 
 		 208 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 307 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 307 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 214 aa  50.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  28.02 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 312 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 320 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 214 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 214 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.93 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  31.93 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 240 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  31.93 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.99 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.66 
 
 		 242 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.2 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.73 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0926  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.95 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 214 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.32 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  22.15 
 
 		 209 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 310 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.39 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  28.19 
 
 		 302 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 302 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.67 
 
 		 251 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>