121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1358 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
479 aa  996    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  74.32 
 
 
343 aa  250  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
334 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 
300 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
305 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 
300 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.67 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
299 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.62 
 
 
298 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
317 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.11 
 
 
318 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1149  hypothetical protein  48.98 
 
 
229 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0582912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  23.66 
 
 
287 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.42 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 
307 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  21.37 
 
 
316 aa  57  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 
339 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  36.59 
 
 
239 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
307 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.79 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 
322 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 
339 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 
319 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
330 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 
305 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 
319 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.2 
 
 
319 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
322 aa  53.5  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.19 
 
 
334 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
319 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.22 
 
 
335 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.22 
 
 
335 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  22.67 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.55 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 
312 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  25.15 
 
 
339 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.58 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  23.48 
 
 
319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0445  proteinase inhibitor I1, Kazal  56.76 
 
 
113 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.4 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
319 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
336 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 
342 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
321 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
302 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  22.88 
 
 
444 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0845  proteinase inhibitor I1, Kazal  57.14 
 
 
261 aa  50.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  23.08 
 
 
319 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.19 
 
 
314 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 
425 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
488 aa  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
320 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2866  proteinase inhibitor I1 Kazal  34.44 
 
 
125 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0117026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.35 
 
 
333 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  23.89 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  24.68 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
294 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  22.03 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  23 
 
 
313 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  20.45 
 
 
321 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  24.82 
 
 
257 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.52 
 
 
321 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.82 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  21.15 
 
 
316 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
320 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1241  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  47  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 
342 aa  47  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  22.09 
 
 
313 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1166  proteinase inhibitor I1, Kazal  39.68 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  23.17 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 
319 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 
319 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>