124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1117 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  736    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.89 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.02 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.05 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.56 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.01 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.28 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.45 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  35.23 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 661 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.93 
 
 		 617 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 591 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.42 
 
 		 661 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.42 
 
 		 661 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 661 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 661 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 308 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 661 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  27.37 
 
 		 661 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.29 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  27.37 
 
 		 661 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 		 680 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  37.04 
 
 		 645 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  24.05 
 
 		 653 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  35.53 
 
 		 662 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 654 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.16 
 
 		 1290 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.64 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  23.22 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  41.89 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  20.29 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 611 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  21.55 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 677 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.63 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.55 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.55 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 655 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  22.14 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.33 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  20.55 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  35.06 
 
 		 655 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.61 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 654 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 675 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 658 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  19.2 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>