107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2981 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  72.2 
 
 		 617 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  52.35 
 
 		 653 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  49.02 
 
 		 660 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  51.14 
 
 		 662 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  67.75 
 
 		 651 aa  948    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  67.75 
 
 		 651 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  67.69 
 
 		 653 aa  942    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1357    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  51.44 
 
 		 654 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  48.31 
 
 		 660 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  49.29 
 
 		 653 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  50.95 
 
 		 631 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  48.81 
 
 		 667 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  48.52 
 
 		 658 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 		 659 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  48.91 
 
 		 658 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 652 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  48.28 
 
 		 655 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  52.08 
 
 		 657 aa  677    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  50.76 
 
 		 656 aa  684    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  50.08 
 
 		 655 aa  668    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  52.27 
 
 		 657 aa  680    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  48.77 
 
 		 657 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  48.35 
 
 		 658 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.23 
 
 		 661 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  48.33 
 
 		 661 aa  628  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  48.19 
 
 		 658 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  48.17 
 
 		 661 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  47.85 
 
 		 661 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  47.34 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  47.69 
 
 		 661 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  47.85 
 
 		 661 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  47.77 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.01 
 
 		 661 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  47.39 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  49.19 
 
 		 611 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  46.85 
 
 		 648 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  47.24 
 
 		 661 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  48.8 
 
 		 653 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  47.46 
 
 		 626 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  46.39 
 
 		 677 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  46.59 
 
 		 675 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  48.02 
 
 		 673 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  45.83 
 
 		 648 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  47.94 
 
 		 625 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  47.94 
 
 		 625 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  48.73 
 
 		 629 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  45.44 
 
 		 654 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  47.78 
 
 		 625 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  47.49 
 
 		 621 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  45.61 
 
 		 641 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 		 680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 		 625 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  47.24 
 
 		 1290 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  44.69 
 
 		 696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  45.56 
 
 		 670 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  46.03 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  43.97 
 
 		 691 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  43.29 
 
 		 704 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  45.29 
 
 		 701 aa  558  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 687 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  43.13 
 
 		 704 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  44.91 
 
 		 655 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  43.02 
 
 		 659 aa  537  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  44.68 
 
 		 607 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  46.67 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  39.81 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  40.61 
 
 		 653 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 		 661 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 673 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 663 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  40.69 
 
 		 668 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  42.21 
 
 		 662 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 		 662 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.56 
 
 		 663 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41 
 
 		 666 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 		 662 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  42.88 
 
 		 657 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 683 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  28.96 
 
 		 635 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  38.12 
 
 		 357 aa  248  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  50.51 
 
 		 225 aa  212  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 425 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  26.88 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  73.85 
 
 		 67 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  23.15 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  22.25 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  23.13 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  22.88 
 
 		 417 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  21.39 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>