107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0357 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 617 aa  1279    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  51.3 
 
 		 653 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 		 657 aa  641    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  51.47 
 
 		 660 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  52.27 
 
 		 662 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  70.66 
 
 		 651 aa  936    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  70.5 
 
 		 651 aa  932    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  66.61 
 
 		 653 aa  879    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  72.2 
 
 		 654 aa  951    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  50.41 
 
 		 660 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  50.73 
 
 		 631 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  49.92 
 
 		 667 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  49.67 
 
 		 658 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  50.33 
 
 		 658 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  51.45 
 
 		 652 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  49.67 
 
 		 655 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  52.27 
 
 		 656 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  50.89 
 
 		 655 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  52.1 
 
 		 657 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  49.51 
 
 		 659 aa  631  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  48.39 
 
 		 658 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  48.06 
 
 		 658 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  50.33 
 
 		 611 aa  618  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  51.21 
 
 		 654 aa  618  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  49.84 
 
 		 653 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  48.05 
 
 		 661 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  48.05 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  48.95 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  50.73 
 
 		 629 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  48.05 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.73 
 
 		 661 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.73 
 
 		 661 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  47.89 
 
 		 661 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  47.73 
 
 		 661 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  48.21 
 
 		 673 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  49.68 
 
 		 653 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  46.24 
 
 		 677 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 		 696 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  45.93 
 
 		 648 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  46.84 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  46.18 
 
 		 648 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 680 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  47.01 
 
 		 636 aa  586  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  47 
 
 		 661 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  45.72 
 
 		 661 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  46.42 
 
 		 670 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  45.94 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  47.16 
 
 		 626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  46.59 
 
 		 654 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 		 675 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  46.44 
 
 		 701 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  46.28 
 
 		 621 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  46.02 
 
 		 687 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  45.66 
 
 		 641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 625 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 		 704 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  47.3 
 
 		 1290 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  47.15 
 
 		 625 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  47.15 
 
 		 625 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 625 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 		 704 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 		 628 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 659 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  47.97 
 
 		 645 aa  535  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 		 607 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  45.15 
 
 		 655 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  42.37 
 
 		 700 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  41.16 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  40.58 
 
 		 653 aa  492  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  42.56 
 
 		 609 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  42.04 
 
 		 668 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 		 661 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 657 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 673 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.57 
 
 		 663 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 		 662 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 		 662 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 		 662 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 		 662 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.28 
 
 		 666 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  41.24 
 
 		 663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 683 aa  359  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  29.39 
 
 		 635 aa  269  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  38.99 
 
 		 357 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 		 225 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 591 aa  196  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  28.86 
 
 		 491 aa  153  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  26.78 
 
 		 444 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  78.12 
 
 		 67 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  23.13 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  22.11 
 
 		 441 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  23.33 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  23 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  22.9 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>