163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3402 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  68.28 
 
 
230 aa  291  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  59.15 
 
 
250 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  31.6 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  34.16 
 
 
335 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  34.16 
 
 
335 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
336 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  31.6 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  33.5 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  31.82 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.96 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  31.47 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.98 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.92 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  30.3 
 
 
312 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
332 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 
298 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
317 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
310 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
318 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
310 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 
318 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.78 
 
 
316 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  32.74 
 
 
316 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
319 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  27.18 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
305 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  33.14 
 
 
316 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
351 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.53 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.74 
 
 
318 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.89 
 
 
364 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.65 
 
 
323 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.12 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1844  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
317 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
364 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.84 
 
 
317 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  27.86 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.42 
 
 
314 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
347 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.58 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  26.15 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
313 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 
315 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>