142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2456 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2456  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
559 aa  1105    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0061  hypothetical protein  31.73 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 
211 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
231 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  30 
 
 
224 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 
208 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  24.4 
 
 
207 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
231 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 
213 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
208 aa  56.2  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
202 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
210 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
231 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
198 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.85 
 
 
213 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  42.25 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 
207 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
214 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.15 
 
 
204 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
209 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
209 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
202 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  33.48 
 
 
203 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 
209 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
231 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  29.2 
 
 
210 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
206 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
205 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 
234 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
229 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
220 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  53.49 
 
 
213 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  31.2 
 
 
229 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  36.78 
 
 
217 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  24.52 
 
 
206 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
205 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
208 aa  50.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
206 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  24.6 
 
 
206 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
205 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
225 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
225 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
205 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.7 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
208 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 
217 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
233 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.63 
 
 
205 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  30.5 
 
 
295 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 
203 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
324 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
221 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
234 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  28.9 
 
 
231 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
215 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
263 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
225 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  27.16 
 
 
218 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
206 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
222 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
220 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 
213 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 
195 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
238 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 
208 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
206 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
217 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  32.61 
 
 
213 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.32 
 
 
208 aa  47.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  39.77 
 
 
216 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  31.92 
 
 
192 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 
214 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
225 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
313 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
231 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  25.21 
 
 
200 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  23.98 
 
 
200 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
314 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  58.82 
 
 
213 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
205 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  40.24 
 
 
207 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  40.58 
 
 
215 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 
211 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  25.84 
 
 
201 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  25.57 
 
 
225 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
226 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
303 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
205 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
209 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 
210 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>