256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0531 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  97.73 
 
 
308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  65.35 
 
 
317 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  64.19 
 
 
310 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  61.11 
 
 
306 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  60.39 
 
 
319 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  59.87 
 
 
308 aa  363  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  59.87 
 
 
309 aa  359  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  57.81 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  54.85 
 
 
307 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  56.04 
 
 
314 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  52.44 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 
317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  53.25 
 
 
317 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.79 
 
 
306 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  52.86 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  56.38 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  55.14 
 
 
306 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  43.33 
 
 
304 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
306 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
329 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
215 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.2 
 
 
215 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
215 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.2 
 
 
215 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  35.59 
 
 
214 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
214 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  30.6 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.86 
 
 
215 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
215 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
215 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
215 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  28.71 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 
214 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  30.1 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  32.24 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 
198 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
214 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
251 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 
214 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  21.46 
 
 
246 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
209 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  22.51 
 
 
231 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.14 
 
 
222 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.45 
 
 
260 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
215 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.85 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  29.73 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.49 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  22.78 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.83 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.86 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 
396 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.19 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
355 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
231 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  26.47 
 
 
257 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
212 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>