More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1077 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  50.95 
 
 
215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  49.07 
 
 
237 aa  214  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  49.76 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  50.48 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  50.48 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  50.48 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  50.48 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  49.53 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  50.48 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  50.48 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  50.48 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  50.91 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
215 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  50 
 
 
222 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  50.48 
 
 
214 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  51.4 
 
 
214 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  50.48 
 
 
214 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  50.48 
 
 
214 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  48.1 
 
 
215 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  48.1 
 
 
222 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  48.6 
 
 
215 aa  207  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  48.6 
 
 
217 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  50.95 
 
 
214 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 
218 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
215 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
215 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
215 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
215 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
215 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  50 
 
 
230 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  48.37 
 
 
218 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  48.37 
 
 
218 aa  204  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  48.37 
 
 
216 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 
215 aa  204  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
214 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
221 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  45.33 
 
 
214 aa  203  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  51.9 
 
 
213 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  50.95 
 
 
213 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  46.26 
 
 
214 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  49.05 
 
 
222 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  47.2 
 
 
215 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.73 
 
 
212 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
214 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  43.46 
 
 
215 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 
215 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  46.73 
 
 
213 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.99 
 
 
215 aa  201  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 
214 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  49.52 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  45.79 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  46.73 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  51.42 
 
 
215 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  45.33 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  46.98 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  47.2 
 
 
226 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  47.66 
 
 
212 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  46.98 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  42.06 
 
 
214 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  46.98 
 
 
218 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  41.59 
 
 
214 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 
214 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 
214 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  46.73 
 
 
224 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 
215 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  45.24 
 
 
215 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  45.33 
 
 
211 aa  191  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  45.33 
 
 
218 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
214 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
215 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  42.52 
 
 
241 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  42.06 
 
 
214 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  42.01 
 
 
222 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  42.99 
 
 
216 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  44.86 
 
 
212 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 
214 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  43.46 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.93 
 
 
214 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  43.93 
 
 
214 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.54 
 
 
215 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  42.06 
 
 
217 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  44.71 
 
 
240 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  43.93 
 
 
218 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 
213 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 
212 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 
216 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  44.39 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>