251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2141 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 354 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  36.26 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  39.18 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  38.68 
 
 		 341 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  37.17 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  35.19 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  37.17 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  37.2 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  37.94 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  38.35 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 383 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 384 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  37.24 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  33.43 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.78 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  35.33 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  35.69 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  35.99 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  35.99 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  36.23 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  36.07 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  35.19 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  32.75 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  33.14 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  34.42 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  35.49 
 
 		 349 aa  185  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.1 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  36.28 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  33.44 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  30.21 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  33.02 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.85 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.12 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.82 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.16 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 862 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  24.78 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>