290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1469 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  24.92 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  33.13 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  25.66 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  25.31 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  27.76 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.78 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  25.64 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  28.85 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  24.06 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  24.91 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  23.08 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  26.63 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
556 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  23.35 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.95 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25.95 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  27.05 
 
 
550 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
568 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 
568 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 
323 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  22.9 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.44 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  28.83 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  26.92 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
394 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  25.66 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  23.57 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.1 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  24.35 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  24.54 
 
 
352 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  25.7 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>