More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2180 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  57.64 
 
 
582 aa  691    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  68.82 
 
 
591 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  71.78 
 
 
589 aa  905    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.63 
 
 
575 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  53.48 
 
 
576 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  52.87 
 
 
579 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  57.09 
 
 
574 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  100 
 
 
582 aa  1196    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  90.55 
 
 
582 aa  1118    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  65.17 
 
 
591 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  68.46 
 
 
592 aa  861    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  58.08 
 
 
571 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  53.14 
 
 
572 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  65.34 
 
 
591 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.63 
 
 
575 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.48 
 
 
576 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  66.09 
 
 
591 aa  852    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  65.52 
 
 
591 aa  856    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  79.86 
 
 
591 aa  986    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  57.12 
 
 
575 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.55 
 
 
575 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.14 
 
 
576 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.48 
 
 
574 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.63 
 
 
575 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  51.55 
 
 
638 aa  599  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  41.11 
 
 
570 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.45 
 
 
573 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.57 
 
 
569 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.48 
 
 
573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.48 
 
 
573 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  37.26 
 
 
574 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.89 
 
 
601 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  36.9 
 
 
584 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  35.64 
 
 
597 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.54 
 
 
585 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  33.88 
 
 
598 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  32.2 
 
 
575 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  33.05 
 
 
613 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
576 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  34.54 
 
 
597 aa  329  8e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
571 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  32.9 
 
 
615 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
571 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  31.63 
 
 
600 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  31.33 
 
 
600 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  31.97 
 
 
593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
616 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  31.39 
 
 
600 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  34.18 
 
 
588 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  35.55 
 
 
500 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 
399 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.67 
 
 
399 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  30.12 
 
 
878 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  30.18 
 
 
878 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 
397 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 
396 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
425 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
407 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  32.89 
 
 
884 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
400 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  30.51 
 
 
407 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  31.07 
 
 
508 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
407 aa  204  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  29.44 
 
 
407 aa  204  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 
395 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
395 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
395 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.22 
 
 
423 aa  180  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.08 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  32.74 
 
 
409 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25.72 
 
 
392 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.74 
 
 
500 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  30.79 
 
 
431 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.85 
 
 
499 aa  160  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.14 
 
 
405 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  27.45 
 
 
399 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.38 
 
 
493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 
396 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.81 
 
 
494 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
400 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.16 
 
 
397 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.03 
 
 
394 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
396 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.25 
 
 
498 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
407 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  22.87 
 
 
397 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 
384 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  24.94 
 
 
396 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.99 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.3 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  27.23 
 
 
395 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.45 
 
 
479 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>