291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3407 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  33.06 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  32.03 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  32.57 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  32.17 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  32 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  27.35 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  34.34 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.21 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.94 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  26.51 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.62 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  28.37 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.36 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.04 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  29.59 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  30.62 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  24.9 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  28.43 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  28.16 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.18 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  29.71 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  32.8 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  28.81 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.22 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.59 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>