142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2976 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  54.72 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  53.54 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  52.57 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  54.44 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  54.44 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  54.03 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  51.16 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  53.31 
 
 		 276 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.83 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  41.63 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  37.88 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  33.75 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  25.9 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  34.59 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1608  hypothetical protein  60.42 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  29.15 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  25.24 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  28.05 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  28 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0170  hypothetical protein  24.19 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  30.54 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  30.48 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.23 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  29.07 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  27.32 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.69 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.23 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 317 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.55 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  24.54 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.89 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.95 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 305 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>