169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5790 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  553  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  75.56 
 
 		 266 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  66.03 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  66.03 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  65.65 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  59.53 
 
 		 269 aa  341  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  54.72 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  49.05 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  51.19 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  43.62 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  44.49 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  39.64 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.37 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  29.68 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.93 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.44 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  35.11 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  25.66 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  23.7 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  30 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.69 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.74 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1608  hypothetical protein  49.09 
 
 		 191 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1176  hypothetical protein  25.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.850669  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24.27 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.34 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 330 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  24.26 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  22.45 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  24.17 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  22.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  28.9 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  23.22 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  22.65 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 310 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  26.36 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 314 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>