211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2298 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  71.66 
 
 
248 aa  377  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  65.59 
 
 
248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  65.59 
 
 
249 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 
248 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  64.78 
 
 
248 aa  348  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  32.07 
 
 
308 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  28.44 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.5 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  31.45 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  22.87 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  26.11 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  32.48 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  32.48 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  32.48 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  32.48 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  27.22 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.41 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  27.48 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
324 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  24.84 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
294 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  26.63 
 
 
282 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.02 
 
 
287 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  23.79 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  27.96 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  25.48 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.59 
 
 
327 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.45 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  22.59 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.54 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.82 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
282 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 
327 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
302 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
317 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 
315 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  24.51 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.09 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  25.57 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  26.52 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.64 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  21.71 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28.18 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
298 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
326 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  24.24 
 
 
339 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
287 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>