258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3391 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  46.62 
 
 		 276 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  44.79 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  43.44 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  42.74 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  42.74 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  42.34 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  38.02 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  39 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  38.25 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.77 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  34.97 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.05 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.65 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  25.73 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.28 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.91 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.74 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  29.33 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.31 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  32.1 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  23.11 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  26.94 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.3 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  31.52 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.98 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1176  hypothetical protein  26.04 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.850669  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  31.71 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.05 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  23.43 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>