285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  34.54 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
248 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  27.19 
 
 
308 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  32.09 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  32.88 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  26.02 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  30.04 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  31.76 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.43 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.59 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  30.14 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  27.87 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  27.31 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  26.59 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  32.76 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  27.57 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.49 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.71 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  31.38 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.49 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  30.1 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  21.78 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  26.14 
 
 
332 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  28.31 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 
176 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  36.97 
 
 
263 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
312 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
333 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
327 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.74 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1727  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.84 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>