186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3256 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  62.64 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  62.64 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  62.26 
 
 		 270 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  59.53 
 
 		 266 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  60.77 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  52.57 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  52.85 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  47.35 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  44.66 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.35 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  42.34 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  40.56 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  33.02 
 
 		 253 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  33.53 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  34.55 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  32.13 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  26.2 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  28.76 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  30.99 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  31.71 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  22.52 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  33.97 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  30 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  27.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  25.23 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  31.21 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  23.03 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  26.56 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0170  hypothetical protein  23.29 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  21.79 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.94 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  27.72 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.07 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>