219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0986 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  100 
 
 
271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
270 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  49.63 
 
 
270 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  50.38 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  49.05 
 
 
266 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  51.16 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  45.04 
 
 
276 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 
297 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.02 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  39.34 
 
 
265 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  38.49 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 
262 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.41 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  31.08 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  29.1 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.38 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  32.91 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0170  hypothetical protein  28.63 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  29.49 
 
 
297 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.95 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  26.64 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.48 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
299 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.52 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.76 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.31 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.76 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.04 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.76 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  30.12 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  23.31 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.32 
 
 
339 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
333 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  28.48 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  29.35 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  23.11 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  21.67 
 
 
329 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  23.73 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>