185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1218 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  99.26 
 
 
270 aa  554  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  99.63 
 
 
270 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  66.03 
 
 
266 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  64.15 
 
 
266 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  62.64 
 
 
269 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  50 
 
 
271 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  54.44 
 
 
266 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  53.53 
 
 
276 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  44.44 
 
 
265 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 
297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  42.74 
 
 
266 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  40.32 
 
 
276 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
262 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  31.11 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.98 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.93 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
284 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  29.94 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  30.5 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 
248 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.7 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 
278 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1608  hypothetical protein  54.55 
 
 
191 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.22 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  28.65 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.37 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.61 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  25.82 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  24.36 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  23.7 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.57 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  29.67 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  25.95 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0170  hypothetical protein  24.29 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
233 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  22.63 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  26.01 
 
 
248 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.51 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
293 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
318 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
235 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.07 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  24.71 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.86 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  26.54 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  23.78 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  26.32 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>