160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3180 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  82.26 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  73.39 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  65.59 
 
 		 248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  69.39 
 
 		 249 aa  354  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  67.21 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.38 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  30.43 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  26.36 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24.48 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  27.94 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.49 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.49 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.49 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.89 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.48 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.33 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.14 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  29.06 
 
 		 304 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 		 287 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  29.94 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  31.13 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  28.31 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  28.39 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  24.57 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  25.23 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  25.23 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  29.28 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 329 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.41 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 329 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  26.62 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  27.15 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  26.62 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.61 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  24.2 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  23.28 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.44 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.35 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>