62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4804 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  27.92 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  30.9 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  28.65 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.07 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  28.25 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.17 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  26.48 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  30.82 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  26.97 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  22.56 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  26.82 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  24.57 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>