156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1237 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 
248 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  66.8 
 
 
248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  67.21 
 
 
248 aa  348  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  66.53 
 
 
248 aa  342  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  65.85 
 
 
249 aa  340  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  29.32 
 
 
308 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.32 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  30.48 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  27.2 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.02 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  26.85 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0170  hypothetical protein  25.86 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.99 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  23.29 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  24.69 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  23.04 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
324 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  27.11 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
335 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  26.51 
 
 
288 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 
327 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
229 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  26.83 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
281 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
322 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  24.7 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  22.37 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  26.27 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  22.47 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  25.15 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  24.19 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  24.42 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
288 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
280 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
280 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  25.77 
 
 
284 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
288 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  23.92 
 
 
339 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  23.18 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  22.22 
 
 
339 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1176  hypothetical protein  25.57 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.850669  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  26.11 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  25.15 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  26.47 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
269 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  25.32 
 
 
326 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>