237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0307 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  52.88 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
209 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 
207 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.69 
 
 
237 aa  72  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
306 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
305 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  27.11 
 
 
309 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
291 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
319 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
308 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
306 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
312 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
249 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
322 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  26.47 
 
 
307 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
321 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
318 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  25.43 
 
 
298 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 
316 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 
361 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
321 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
310 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 
330 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
322 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  22.42 
 
 
282 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.04 
 
 
311 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
310 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
285 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  30.08 
 
 
326 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 
323 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  30.08 
 
 
326 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  25.47 
 
 
331 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 
323 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 
323 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  26.52 
 
 
287 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  26.35 
 
 
351 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.85 
 
 
316 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
310 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
324 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  28.1 
 
 
337 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  28.75 
 
 
326 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  27.38 
 
 
342 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 
323 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  26.54 
 
 
309 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 
324 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
328 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  28.66 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
278 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
305 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  23.6 
 
 
263 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
288 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 
324 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 
329 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 
273 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
333 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 
308 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
334 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  27.22 
 
 
299 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.56 
 
 
255 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
302 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  23.98 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  24.85 
 
 
310 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
310 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
312 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  24.68 
 
 
284 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 
280 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  26.62 
 
 
320 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>