154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3579 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
235 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  36.57 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  35.81 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  23.35 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  25.09 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  28.27 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  28.04 
 
 
271 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  27.38 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  26.57 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.43 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  30.09 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  25.14 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  27.54 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  25.13 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 
208 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  25.75 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 
250 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
185 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  25.75 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 
250 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  25.21 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 
250 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
283 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
302 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  23.49 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  25.21 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  25.32 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.82 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  23.78 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.21 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  26.5 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  26.5 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  29.35 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 
339 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  27.64 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
174 aa  49.3  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.93 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
223 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  24.29 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  24.39 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 
284 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 
243 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  27.31 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  30.46 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  29.67 
 
 
266 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.57 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 
174 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  24.19 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
200 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
311 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>