79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03883 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  42.29 
 
 		 299 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  35 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 		 284 aa  72  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  33.87 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  37.36 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.42 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  33.33 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  35.45 
 
 		 411 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  31.93 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  28.87 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  28.87 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.48 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  31.9 
 
 		 310 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  28.36 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  27.84 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 302 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  27.82 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.1 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  38.18 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  27.91 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 312 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  31.46 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  32.58 
 
 		 229 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 288 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  32.94 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 		 399 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>