119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3173 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  42.75 
 
 		 266 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  41.44 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  40.61 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  44.28 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  43.84 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  29.82 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  29.36 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.83 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  25.57 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  26.76 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 302 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  24.43 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  21.25 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 233 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 315 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  23.04 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  23.5 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  23.85 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.58 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  22.1 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  22.55 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  22.55 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  22.55 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  25.4 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  26.5 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  24.73 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 341 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  29.76 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.37 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.08 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  24.46 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>