More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 269 aa  556  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  67.29 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  31.15 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  35.76 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.23 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.7 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  31.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.49 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  28.24 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.7 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  23.61 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  32.2 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  27.88 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.25 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  27.56 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  26.59 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  44.64 
 
 		 397 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  26.92 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  26.92 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 397 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  26.92 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.27 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.06 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 329 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 333 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  27.69 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  27.54 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.14 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.84 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28.06 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  27.55 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>