247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0462 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 269 aa  556  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  67.29 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.06 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  25.45 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  29.45 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.47 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  27.81 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  28.19 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.43 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  22.44 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  25.64 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 322 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.62 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.59 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.26 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  26.11 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 397 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.61 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 315 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.86 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  25.12 
 
 		 217 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  23.38 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  25.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  21.14 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  27.88 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.42 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>