More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1412 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  52.59 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  50.54 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  49.28 
 
 
283 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  49.63 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  49.63 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  48.89 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  48.36 
 
 
287 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  50.36 
 
 
279 aa  278  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  47.91 
 
 
287 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  47.15 
 
 
287 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  51.68 
 
 
238 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
279 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 
291 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  39.03 
 
 
293 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 
292 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 
322 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  44.15 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.55 
 
 
339 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  34.16 
 
 
351 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  34.3 
 
 
342 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
301 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
334 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
336 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.48 
 
 
327 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
314 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
341 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.57 
 
 
332 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 
322 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
301 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
336 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
324 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.33 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.43 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
335 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  33.21 
 
 
339 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
329 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 
311 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
327 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  34.43 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  31.16 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
324 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
330 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
332 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
327 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30.18 
 
 
321 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.08 
 
 
300 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
327 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
320 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.99 
 
 
321 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
324 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  35.36 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
315 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  34.29 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
329 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
324 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.55 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  31.97 
 
 
277 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
327 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  30.85 
 
 
339 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  29.89 
 
 
272 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 
333 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  31.54 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
291 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
322 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
326 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
320 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 
331 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
326 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
312 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.18 
 
 
293 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  34.32 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  31.42 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  28.21 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>