59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002733 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  100 
 
 
287 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  36.11 
 
 
287 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  36.65 
 
 
283 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  35.84 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  35.07 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  34.52 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  33.46 
 
 
278 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
268 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
268 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
271 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
268 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 
268 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
268 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
260 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  26.09 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  30.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  24.9 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  25 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  28.21 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  24.14 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  23.46 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.4 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  22.57 
 
 
238 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  22.07 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  20.9 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  22.1 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  22 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  23.59 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 
253 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  22.45 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>