118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4421 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  95.52 
 
 
268 aa  534  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  63.43 
 
 
268 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  61.57 
 
 
268 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  61.19 
 
 
268 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  35.58 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  35.58 
 
 
283 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  34.83 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  34.83 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  35.21 
 
 
282 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
283 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  34.24 
 
 
278 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  33.99 
 
 
287 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  27.34 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  30.23 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  28.12 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.24 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  28.19 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  22.03 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.88 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.06 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0111  hypothetical protein  35.48 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.33 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  22.86 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.22 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  25.82 
 
 
332 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  23.78 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
329 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
324 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  27.46 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  23.49 
 
 
330 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
287 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 
243 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
287 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
291 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  24.5 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  26.67 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  28.37 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.07 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.37 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.17 
 
 
332 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.35 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24.51 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.35 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.35 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.35 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  26.83 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.35 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>