146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1468 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  37.27 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  34.08 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  29.67 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.64 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  28.76 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  28.33 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  24.59 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  24.59 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.69 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  24.49 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  24.18 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  26.14 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 198 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  24.9 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  22.18 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  25.78 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  24.5 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.66 
 
 		 330 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  23.78 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  22.76 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.53 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  23.18 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  34.57 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  29.84 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.95 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  24.87 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  22.88 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  25.98 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  27.08 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  25.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>