64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4355 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  34.85 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  33.47 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  24.71 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  24.71 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  23.94 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  23.94 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  28.96 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  23.91 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  24.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  25.76 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  24.5 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24.73 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  26.2 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 209 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  26.99 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  23.5 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  26.54 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  26.48 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  26.54 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  25.11 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  24.18 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  31.31 
 
 		 136 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  28.3 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.17 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>