47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03884 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  288  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  55.34 
 
 		 299 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  48.25 
 
 		 276 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  46.6 
 
 		 282 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  45.54 
 
 		 284 aa  93.2  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  37.82 
 
 		 287 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 262 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  38.89 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  36.67 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 243 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  31.11 
 
 		 271 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 253 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 282 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  45.16 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  35.92 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  28.15 
 
 		 288 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  28.15 
 
 		 288 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  27.5 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 245 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 244 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 		 298 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 287 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.29 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  32.2 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 324 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>