115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4648 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  71.7 
 
 
266 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  44.07 
 
 
261 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  43.8 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
251 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  41.73 
 
 
258 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 
261 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 
267 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 
271 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
264 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 
253 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  30.17 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  30.17 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  24.03 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  22.36 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  26.57 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  26.94 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 
329 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
294 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.21 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  24.47 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
282 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  29.06 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  31.63 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.35 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.97 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  25.21 
 
 
321 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  24.55 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  24.55 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
324 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  23.95 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.31 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  25.37 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  23.95 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  23.95 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  23.56 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  21.08 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.28 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  27.24 
 
 
351 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  25.14 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  24.73 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>