More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2563 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  67.5 
 
 
285 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  67.86 
 
 
285 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  67.14 
 
 
285 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  67.14 
 
 
285 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  66.07 
 
 
281 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  67.14 
 
 
285 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  68.12 
 
 
281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  66.43 
 
 
285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  67.03 
 
 
281 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  58.2 
 
 
299 aa  291  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  52.59 
 
 
296 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  56.03 
 
 
299 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  56.42 
 
 
299 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  50.74 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  52.71 
 
 
295 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  54.86 
 
 
295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  50.19 
 
 
277 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  51.85 
 
 
322 aa  265  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  51.13 
 
 
294 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 
300 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 
322 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  50.59 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  43.44 
 
 
273 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 
300 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  34.15 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  33.66 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
231 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  33.33 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
231 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  33.77 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  31.9 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  32.42 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  30.67 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29.78 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.17 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
402 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  28.82 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.36 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
192 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.48 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  35.06 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.11 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  33.92 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>