130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1210 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 335 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  38.23 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  32.43 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  36.57 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.17 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  29.76 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.13 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  22.3 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.23 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25.37 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.4 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  43.14 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.51 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.67 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.4 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.22 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.14 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  25.12 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  46.15 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  24.33 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  25.51 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  24.89 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  31.54 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  25.54 
 
 		 211 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 272 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  26.7 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  27.21 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 192 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  45.45 
 
 		 763 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.61 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  20.28 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  27.09 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  53.19 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.09 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.35 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  41.07 
 
 		 737 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.26 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.47 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.81 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.14 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>