More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2040 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  49.28 
 
 		 763 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  51.04 
 
 		 737 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1537    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  49.28 
 
 		 763 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  49.15 
 
 		 763 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  57.2 
 
 		 793 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  87.81 
 
 		 763 aa  1370    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  54.25 
 
 		 747 aa  780    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  43.18 
 
 		 754 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  43.18 
 
 		 754 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  42.39 
 
 		 754 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.39 
 
 		 754 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  42.39 
 
 		 754 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  42.39 
 
 		 754 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  42.78 
 
 		 754 aa  588  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  44.62 
 
 		 754 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  42.31 
 
 		 756 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  43.39 
 
 		 737 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  43.18 
 
 		 737 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  43.04 
 
 		 737 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1048  hypothetical protein  43.18 
 
 		 737 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.486822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  34.4 
 
 		 752 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  32.68 
 
 		 752 aa  320  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  31.07 
 
 		 768 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2411  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 homolog  46.67 
 
 		 343 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  32.25 
 
 		 752 aa  298  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 		 840 aa  293  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.08 
 
 		 812 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.62 
 
 		 773 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.07 
 
 		 773 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1704  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.98 
 
 		 783 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.34 
 
 		 773 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.53 
 
 		 762 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2675  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.56 
 
 		 783 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923098  normal  0.0587505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.42 
 
 		 783 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1667  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.31 
 
 		 795 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.38 
 
 		 769 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.54 
 
 		 798 aa  261  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.44 
 
 		 774 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.16 
 
 		 860 aa  253  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 		 761 aa  250  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1818  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.37 
 
 		 765 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0856288  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.65 
 
 		 841 aa  239  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.38 
 
 		 765 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  28 
 
 		 735 aa  233  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  28.06 
 
 		 735 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.1 
 
 		 802 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.7 
 
 		 784 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  33.06 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  28.79 
 
 		 747 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.47 
 
 		 767 aa  223  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.02 
 
 		 801 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.58 
 
 		 822 aa  221  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.22 
 
 		 839 aa  217  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.94 
 
 		 840 aa  210  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  29.38 
 
 		 847 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.38 
 
 		 772 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.72 
 
 		 839 aa  207  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.62 
 
 		 776 aa  207  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.53 
 
 		 801 aa  205  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.78 
 
 		 738 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.21 
 
 		 766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.44 
 
 		 737 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.89 
 
 		 799 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.72 
 
 		 738 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 		 737 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.36 
 
 		 878 aa  195  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01854  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 		 867 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.34 
 
 		 800 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.26 
 
 		 851 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 		 819 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.3 
 
 		 766 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1611  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.4 
 
 		 741 aa  188  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804409  normal  0.12587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  28.93 
 
 		 801 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.94 
 
 		 778 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.34 
 
 		 948 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.85 
 
 		 929 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  36.92 
 
 		 808 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.3 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.83 
 
 		 831 aa  178  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.96 
 
 		 845 aa  178  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1443  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.73 
 
 		 843 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.56 
 
 		 835 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 833 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.59 
 
 		 747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2021  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.67 
 
 		 833 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.130557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.25 
 
 		 830 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  26.66 
 
 		 846 aa  168  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2148  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.67 
 
 		 829 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2200  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.43 
 
 		 873 aa  164  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.27 
 
 		 860 aa  164  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.09 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25480  putative competence protein  28.23 
 
 		 741 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1744  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.16 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 		 842 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.98 
 
 		 758 aa  157  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>