More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2209 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  48.48 
 
 
763 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  48.61 
 
 
763 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  48.64 
 
 
737 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  48.61 
 
 
763 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  63.62 
 
 
793 aa  907    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  100 
 
 
747 aa  1465    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  54.03 
 
 
763 aa  811    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  54.66 
 
 
763 aa  802    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  43.77 
 
 
754 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  43.77 
 
 
754 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  43.63 
 
 
754 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  43.24 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.24 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  43.24 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  43.24 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  45.61 
 
 
754 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  43.62 
 
 
756 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  44.35 
 
 
737 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  44.35 
 
 
737 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1048  hypothetical protein  44.63 
 
 
737 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.486822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  44.43 
 
 
737 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  32.14 
 
 
808 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  32.2 
 
 
752 aa  312  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  32.89 
 
 
768 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  34.13 
 
 
752 aa  299  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  32.91 
 
 
752 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2411  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 homolog  46.43 
 
 
343 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.42 
 
 
761 aa  286  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.06 
 
 
840 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.57 
 
 
773 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2675  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
783 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923098  normal  0.0587505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1704  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.93 
 
 
783 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286912  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.23 
 
 
762 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.18 
 
 
773 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.78 
 
 
783 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.32 
 
 
812 aa  260  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.44 
 
 
798 aa  259  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.57 
 
 
773 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.78 
 
 
860 aa  258  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1818  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.84 
 
 
765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0856288  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1667  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.36 
 
 
795 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.99 
 
 
767 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.16 
 
 
765 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.89 
 
 
801 aa  244  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.43 
 
 
802 aa  241  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.15 
 
 
774 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.06 
 
 
841 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.55 
 
 
769 aa  234  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  31.52 
 
 
847 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  28.11 
 
 
735 aa  230  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  27.95 
 
 
735 aa  227  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.79 
 
 
772 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.93 
 
 
737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1611  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.23 
 
 
741 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804409  normal  0.12587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.85 
 
 
819 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  31.87 
 
 
747 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.22 
 
 
840 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.11 
 
 
738 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.6 
 
 
839 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.21 
 
 
799 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.61 
 
 
737 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  33.28 
 
 
825 aa  217  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.15 
 
 
845 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.33 
 
 
738 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.68 
 
 
835 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
851 aa  214  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.35 
 
 
784 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  32.97 
 
 
846 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.61 
 
 
801 aa  213  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 
929 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.14 
 
 
822 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.09 
 
 
770 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
856 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
856 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
856 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
842 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  33.43 
 
 
801 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.09 
 
 
856 aa  207  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.09 
 
 
856 aa  207  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.14 
 
 
829 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.95 
 
 
842 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01854  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
867 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.95 
 
 
831 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.76 
 
 
878 aa  203  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.98 
 
 
740 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2021  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 
833 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.130557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32 
 
 
833 aa  200  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.92 
 
 
747 aa  200  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.53 
 
 
766 aa  200  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.03 
 
 
776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.09 
 
 
800 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 
839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.43 
 
 
829 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.43 
 
 
829 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.03 
 
 
738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2148  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.65 
 
 
829 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.02 
 
 
861 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
830 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
778 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.87 
 
 
948 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>