More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1667 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  47.43 
 
 		 761 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  63.93 
 
 		 769 aa  939    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  95.35 
 
 		 783 aa  1451    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1667  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 		 795 aa  1595    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.59 
 
 		 812 aa  723    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  69.76 
 
 		 774 aa  1056    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1818  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  50.13 
 
 		 765 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0856288  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1704  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  95.85 
 
 		 783 aa  1457    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  51.5 
 
 		 767 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  63.99 
 
 		 773 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  64.12 
 
 		 773 aa  972    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2675  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  95.22 
 
 		 783 aa  1445    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923098  normal  0.0587505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  64.87 
 
 		 773 aa  1000    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.47 
 
 		 831 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.42 
 
 		 765 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2200  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.74 
 
 		 873 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.65 
 
 		 762 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 763 aa  307  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 763 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  33.48 
 
 		 737 aa  304  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.43 
 
 		 798 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.16 
 
 		 784 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  32.1 
 
 		 754 aa  298  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  31.68 
 
 		 752 aa  297  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.4 
 
 		 839 aa  293  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  31.41 
 
 		 754 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  31.59 
 
 		 763 aa  283  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  30.93 
 
 		 754 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  30.93 
 
 		 754 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.93 
 
 		 754 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  30.93 
 
 		 754 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  30.93 
 
 		 754 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  30.96 
 
 		 754 aa  280  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  28.72 
 
 		 752 aa  280  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  28.54 
 
 		 752 aa  277  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  30.56 
 
 		 756 aa  277  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.19 
 
 		 802 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  33.14 
 
 		 763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  30.71 
 
 		 737 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.31 
 
 		 841 aa  273  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  30.42 
 
 		 737 aa  274  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.55 
 
 		 801 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  29.33 
 
 		 768 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  30.56 
 
 		 737 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1048  hypothetical protein  30.42 
 
 		 737 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.486822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  32.7 
 
 		 793 aa  267  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  29.19 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  32.13 
 
 		 825 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  32.35 
 
 		 747 aa  263  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  30.29 
 
 		 847 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.29 
 
 		 766 aa  260  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.87 
 
 		 822 aa  259  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.82 
 
 		 840 aa  259  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.5 
 
 		 839 aa  255  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.36 
 
 		 819 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.46 
 
 		 772 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.79 
 
 		 740 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  31.56 
 
 		 747 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.96 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.22 
 
 		 845 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.94 
 
 		 747 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.7 
 
 		 851 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.66 
 
 		 766 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  28.87 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  28.96 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.14 
 
 		 778 aa  231  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.87 
 
 		 830 aa  228  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.41 
 
 		 776 aa  227  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.76 
 
 		 737 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.1 
 
 		 860 aa  225  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2148  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.74 
 
 		 829 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.43 
 
 		 948 aa  224  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 		 829 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 		 829 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.33 
 
 		 829 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.22 
 
 		 833 aa  222  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01854  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.73 
 
 		 867 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 		 801 aa  220  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  28.34 
 
 		 801 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.15 
 
 		 738 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 		 800 aa  218  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1443  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 		 843 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.9 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.74 
 
 		 929 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.84 
 
 		 878 aa  215  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2021  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.49 
 
 		 833 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.130557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.76 
 
 		 738 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 		 845 aa  210  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.76 
 
 		 832 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.76 
 
 		 861 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.39 
 
 		 842 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 842 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.22 
 
 		 840 aa  190  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34 
 
 		 860 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>