More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1242 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  71.05 
 
 
269 aa  388  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  70.94 
 
 
278 aa  383  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
301 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0841  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
296 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0550321  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  34.57 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.43 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.81 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.2 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.88 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.83 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.88 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
200 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  29.12 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  33.59 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.03 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  27.23 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.54 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.91 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  24.12 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  27.4 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.66 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  22.48 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.67 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.46 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.18 
 
 
263 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.25 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  30.63 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.4 
 
 
317 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.06 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.5 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.59 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.77 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  28.07 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.48 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.14 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
192 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.14 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.95 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.75 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.75 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>